Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sde2Q8K1J5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sde2Q8K1J5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms