Protein–RNA interactions for Protein: Q8K136

Scnm1, Sodium channel modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnm1Q8K136 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnm1Q8K136 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms