Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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