Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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