Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc63Q8CDV6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc63Q8CDV6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc63Q8CDV6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc63Q8CDV6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc63Q8CDV6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc63Q8CDV6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc63Q8CDV6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc63Q8CDV6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc63Q8CDV6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc63Q8CDV6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc63Q8CDV6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms