Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc178Q8CDV0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms