Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfrp1Q8C4U3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms