Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfrp1Q8BXL7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms