Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms