Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms