Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf41Q8BH75 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf41Q8BH75 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf41Q8BH75 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf41Q8BH75 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf41Q8BH75 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf41Q8BH75 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf41Q8BH75 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf41Q8BH75 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf41Q8BH75 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf41Q8BH75 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf41Q8BH75 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf41Q8BH75 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf41Q8BH75 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf41Q8BH75 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf41Q8BH75 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf41Q8BH75 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms