Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubash3bQ8BGG7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms