Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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