Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm5bQ80Y84 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm5bQ80Y84 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm5bQ80Y84 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm5bQ80Y84 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm5bQ80Y84 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm5bQ80Y84 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms