Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Thnsl2Q80W22 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms