Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms