Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HhipQ7TN16 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HhipQ7TN16 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms