Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ScocQ78YZ6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms