Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rph3alQ768S4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rph3alQ768S4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rph3alQ768S4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rph3alQ768S4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rph3alQ768S4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rph3alQ768S4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rph3alQ768S4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rph3alQ768S4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rph3alQ768S4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rph3alQ768S4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rph3alQ768S4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rph3alQ768S4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rph3alQ768S4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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