Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nemp1Q6ZQE4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms