Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp8b3Q6UQ17 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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