Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx13Q6PHS6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snx13Q6PHS6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx13Q6PHS6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx13Q6PHS6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126 ms