Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc82Q6PG04 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms