Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmeff1Q6PFE7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms