Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms