Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnpQ6P8I4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms