Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Frg2f1Q6P3A2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Frg2f1Q6P3A2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frg2f1Q6P3A2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frg2f1Q6P3A2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frg2f1Q6P3A2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frg2f1Q6P3A2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frg2f1Q6P3A2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frg2f1Q6P3A2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frg2f1Q6P3A2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frg2f1Q6P3A2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frg2f1Q6P3A2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms