Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms