Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc66Q6NS45 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms