Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrp9bQ66X22 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp9bQ66X22 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp9bQ66X22 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp9bQ66X22 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp9bQ66X22 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp9bQ66X22 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp9bQ66X22 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp9bQ66X22 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp9bQ66X22 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp9bQ66X22 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp9bQ66X22 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp9bQ66X22 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp9bQ66X22 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp9bQ66X22 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp9bQ66X22 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp9bQ66X22 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp9bQ66X22 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms