Protein–RNA interactions for Protein: Q64729

Tgfbr1, TGF-beta receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr1Q64729 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr1Q64729 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr1Q64729 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr1Q64729 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms