Protein–RNA interactions for Protein: Q64302

Tm4sf1, Transmembrane 4 L6 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf1Q64302 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm4sf1Q64302 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm4sf1Q64302 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms