Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CochQ62507 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CochQ62507 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CochQ62507 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CochQ62507 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CochQ62507 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CochQ62507 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CochQ62507 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CochQ62507 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CochQ62507 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CochQ62507 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CochQ62507 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CochQ62507 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CochQ62507 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CochQ62507 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CochQ62507 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CochQ62507 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CochQ62507 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CochQ62507 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CochQ62507 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CochQ62507 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CochQ62507 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CochQ62507 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CochQ62507 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CochQ62507 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CochQ62507 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CochQ62507 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CochQ62507 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CochQ62507 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CochQ62507 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CochQ62507 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CochQ62507 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CochQ62507 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CochQ62507 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CochQ62507 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CochQ62507 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CochQ62507 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CochQ62507 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CochQ62507 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CochQ62507 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CochQ62507 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CochQ62507 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CochQ62507 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CochQ62507 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CochQ62507 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CochQ62507 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CochQ62507 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CochQ62507 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CochQ62507 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CochQ62507 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CochQ62507 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CochQ62507 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CochQ62507 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CochQ62507 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CochQ62507 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CochQ62507 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CochQ62507 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CochQ62507 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CochQ62507 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CochQ62507 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CochQ62507 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CochQ62507 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CochQ62507 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CochQ62507 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CochQ62507 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CochQ62507 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CochQ62507 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CochQ62507 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CochQ62507 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CochQ62507 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CochQ62507 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CochQ62507 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CochQ62507 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CochQ62507 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CochQ62507 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CochQ62507 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CochQ62507 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CochQ62507 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms