Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp4Q62445 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sp4Q62445 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms