Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufa4Q62425 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufa4Q62425 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufa4Q62425 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufa4Q62425 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufa4Q62425 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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