Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa13Q62424 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa13Q62424 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms