Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Prm3Q62100 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Prm3Q62100 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Prm3Q62100 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Prm3Q62100 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Prm3Q62100 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Prm3Q62100 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Prm3Q62100 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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Prm3Q62100 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Prm3Q62100 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Prm3Q62100 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prm3Q62100 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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