Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phox2aQ62066 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phox2aQ62066 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Phox2aQ62066 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phox2aQ62066 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phox2aQ62066 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phox2aQ62066 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phox2aQ62066 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phox2aQ62066 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phox2aQ62066 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phox2aQ62066 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phox2aQ62066 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phox2aQ62066 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2aQ62066 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms