Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Odf1Q61999 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Odf1Q61999 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Odf1Q61999 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Odf1Q61999 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf1Q61999 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Odf1Q61999 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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Odf1Q61999 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Odf1Q61999 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Odf1Q61999 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Odf1Q61999 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Odf1Q61999 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Odf1Q61999 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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