Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms