Protein–RNA interactions for Protein: Q61180

Scnn1a, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1aQ61180 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1aQ61180 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1aQ61180 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1aQ61180 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1aQ61180 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1aQ61180 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1aQ61180 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Scnn1aQ61180 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scnn1aQ61180 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1aQ61180 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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