Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna1Q60960 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms