Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vdac1Q60932 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms