Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DbpQ60925 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DbpQ60925 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DbpQ60925 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DbpQ60925 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DbpQ60925 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DbpQ60925 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DbpQ60925 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms