Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms