Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbibQ60778 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms