Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a1Q60714 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc27a1Q60714 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms