Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClpbQ60649 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClpbQ60649 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClpbQ60649 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClpbQ60649 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClpbQ60649 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ClpbQ60649 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ClpbQ60649 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms