Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sin3aQ60520 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms