Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd5Q5VCS6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd5Q5VCS6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms